La plateforme de biologie Intégrée regroupe les quatre plateaux techniques OMICS autour d’un objectif commun : la compréhension de la dynamique des réseaux de régulation des systèmes biologiques et leurs perturbations observées dans les cancers. La complexité des mécanismes de cancérogenèse impose une vision intégrée et non juxtaposée des données scientifiques issues de plusieurs domaines d’investigation ou approches mono technologiques.
Pour répondre à ce défi et pour assurer une compétitivité internationale, l’IGR veille au développement des outils d’intégration (bioinformatique) et des moyens d’investigation de pointe à moyen et haut débit pour la caractérisation des anomalies du génome (séquençage, transcriptome, CGH, microRNA, méthylation etc…) et des métabolites / protéines/ lipides (spectrométrie de masse, RMN, chromatographie), et pour l’étude des corrélations génome / protéome / métabolisme / lipides.
Cette approche méthodologique intégrée constitue un enjeu majeur pour les innovations diagnostiques et thérapeutiques, dans l’objectif d’une prise en charge personnalisée des malades ayant un cancer.
Missions
1. Conseil de haute valeur ajoutée et pilotage des Projets
- Aide à la conception de Projets
- Méthodologie de Projets OMICs'
- Modélisations préalables: (moléculaires/biochimiques, mathématiques)
- Optimisation du plan d’expériences
2. Prestations de services- Qualification des échantillons
- Analyse de données brutes/modélisation/méta-analyses
- Production de données/ réalisation/aide à l’interprétation biologique
- Accompagnement pour réaliser des validations fonctionnelles: notamment aide à la mise en place de tests pour l'analyse fonctionnelle des protéines, RNA ou voies de signalisation candidats.
- Assurance qualité
- Programme de biopsies séquentielles dans le cadre des essais thérapeutiques, en coopération avec SITEP (Service Innovations Thérapeutiques Précoces).
3. Evolution continue des méthodologies- Développement et optimisation des technologies de pointe dans l’investigation à moyen et à haut débit
- Création de pôles de compétences élevées travaillant au sein d’une organisation commune
- Optimisation de l’intégration des données des différentes plateformes.
- Normalisation de la gestion des projets inter-plateformes
- Contribution au développement des innovations diagnostiques et thérapeutiques.
Membres
Philipe Dessen, Virginie Joulin, Vladimir Lazar, Nazanine Modjtahedi, Vasily Ogryzko
