Génétique des cancers des voies aériennes
Présentation du groupe
Travaux et objectifs
La thématique de l’équipe est d’explorer la
génétique, principalement somatique, des cancers du poumon. Accessoirement, des travaux concernent la génétique constitutionnelle des cancers du poumon et la génétique des cancers des voies aériennes supérieures.
- L’objectif est de découvrir de nouveaux gènes de cancer impliqués dans le cancer du poumon par un abord translationnel. Dans un premier temps sont analysées par CGH array des tumeurs humaines, ce qui a permis d’identifier des régions d’intérêt contenant ou pas des gènes de cancers connus. L’étude de ces régions a pour but d’identifier des gènes candidats par l’intégration des altérations du génome (altérations du nombre de copies, translocations, mutations simples, modifications épigénétiques) et du transcriptome (codant et non codant).
Puis, les gènes candidats seront validés d’abord par des tests fonctionnels dans modèles cellulaires appropriées, en cherchant à corréler la modulation de l’expression d’un gène candidat avec le phénotype cellulaire, ce qui sera suivi par le développement d’un modèle murin, grâce à l’expertise de l’unité. Un aspect complémentaire est l’utilisation d’un gène candidat comme marqueur de certains aspects de la maladie (hétérogénéité clinicopathologique ou moléculaire, survie, réponse au traitement).
- L’équipe s’est particulièrement intéressée au profil génomique des adénocarcinomes pulmonaires survenant chez des non fumeurs. Alors que le tabac est la principale cause du cancer du poumon, une proportion de ces cancers survient chez des non fumeurs. La réponse aux thérapeutiques inhibant la signalisation par le récepteur à l’EGF est différente chez ces patients. Les tumeurs ont un profil mutationnel différent. Nous déterminons si d’autres anomalies structurales sont spécifiques aux tumeurs des patients non fumeurs. De plus, l’absence de « bruit de fond » liée à l’absence des milliers de mutations passagères induites par les carcinogènes du tabac favorise la mise en évidence de nouveaux gènes de cancers.
A ce jour (avril 2010), nous sommes au stade de l’intégration des données multidimensionnelles déjà recueillies de façon à établir une liste de priorité de gènes à valider.
Collaborations nationales et internationales
Collaborations nationales
CHU Nice, CHU Toulouse,
CHU Strasbourg (Programme National d’Excellence Spécialisé Poumon, INCa)
Collaborations internationales
Chemores
Activités d'enseignement
UPMC
Brevets
2006 Utilisation de ERCC1 pour prédire le bénéfice de la chimiothérapie comportant du cisplatine. European patent n° 06290407.3
2009 Utilisation de MSH2 pour prédire le bénéfice de la chimiothérapie comportant du cisplatine. Demande EP 09 305 248.8. Numéro de dépôt: PCT/EP2010/053634.
Outils technologiques
QPCR, FISH, immunohistochimie, lignées cellulaires, SiRNA
Thèses soutenues
- MAP kinases et protéines de réparation, PLANCHARD David, novembre 2009,
Université Paris XI, directeur : P. FOURET
Participation aux congrès
- MSH2 and the benefit of adjuvant cisplatin-based chemotherapy in lung
cancer. ASCO Juin 2009 (communication « best of ASCO)
Historique des stagiaires / visiteurs accueillis
- KAMAL Nermine
(2008-2009) : DUERCC (IGR, Villejuif)
Adresse ou position actuelle:
Université du Caire (Egypte)
nerminekamal@hotmail.com
- MOUNTZIOS Giannis
(2007-2008) : DUERCC (IGR, Villejuif)
Adresse ou position actuelle :
University Hospital Alexandra, Dpt. of Clinical Therapeutics, Athens, Greece
gmountzios@med.uoa.gr
- PLANCHARD David
(2006-2007) : DUERCC (IGR, Villejuif)
Adresse ou position actuelle :
Département de médecine, IGR (Villejuif)
David.PLANCHARD@igr.fr
- TAN Han
(2008-2009)
Objet du stage: DUERCC (IGR, Villejuif)
Adresse ou position actuelle : NC
