Plate-Forme Imagerie et Cytométrie
La plate-forme Imagerie et Cytométrie (PFIC) propose les expertises, les équipements innovants et l’environnement appropriés permettant de garantir le support et l’aide au développement des projets scientifiques
Effectif
| LAPLACE-BUILHE Corinne | PhD | Responsable PFIC | corinne.laplace@igr.fr | (33) 1 42 11 66 72 |
| ABBACI Muriel | PhD | Ingénieur de recherche endomicroscopie | muriel.abbaci@igr.fr | (33) 1 42 11 60 15 |
| SALOME-DESNOULEZ Sophie | Magistère | Ingénieur d'études microscopie confocale | sophie.salome-desnoulez@igr.fr | (33) 1 42 11 35 02 |
| LECLUSE Yann | Ingénieur | Chargé de développement
Cytométrie en flux et tri cellulaire
| yann.lecluse@igr.fr | (33) 1 42 11 61 68 ou 41 90 |
| RAMEAU Philippe | Ingénieur CNAM | Ingénieur de recherche Cytométrie en flux, tri cellulaire et imagerie cellulaire haut débit | philippe.rameau@igr.fr | (33) 1 42 11 51 38 |
| ROUFFIAC Valérie | PhD | Ingénieur de recherche imagerie et confocal | valerie.rouffiac@igr.fr | (33) 1 42 11 64 61 |
Travaux et objectifs
La PFIC est une plate-forme de service et de R&D à l’interface de la recherche fondamentale et translationnelle. Cette plate-forme expérimentale fournit aux chercheurs les dernières innovations en matière d'imagerie
photonique et de cytométrie.
Elle s'appuie sur des ressources humaines et instrumentales pour offrir
- Une approche multidisciplinaire de l'imagerie fonctionnelle à l'échelle moléculaire, cellulaire et des organes,
- Une expertise en imagerie photonique des cellules cancéreuses et des modèles murins pour le cancer,
- Une expertise en imagerie transmodalités et en cytométrie quantitative,
- Une politique de partage des connaissances et de collaboration avec des équipes de recherche régionales, nationales et internationales.
La plate-forme est composée d’une équipe de 6 chercheurs et ingénieurs dont le rôle est de proposer un support scientifique et technique pour : la mise en oeuvre de protocoles expérimentaux pour l’imagerie cellulaire, la formation aux instruments, la préparation des échantillons, l'analyse d'images. La PFIC veille également à l’évolution constante de la performance des instruments en imagerie et cytométrie.
La plate-forme assiste tous les projets scientifiques nécessitant l'utilisation de
- L'imagerie confocale et spectrale,
- L’imagerie bioluminescence et fluorescence,
- L'imagerie cellulaire haut débit (HTS), et la production de lames virtuelles,
- La cytométrie en flux multi couleurs, le tri cellulaire haut débit et le clonage.
Les programmes de recherche lancés, en 2009, dans le cadre de la PFIC ont inclus
- Des développements innovants en imagerie non invasive des cancers ORL à l’échelle cellulaire afin de fournir des informations fonctionnelles en complément de l'imagerie morphologique standard. (Projet MEC-ORL).
- Le développement de l'analyse et du tri en cytométrie pour la détection des événements rares en hématologie.
- Le développement de l'imagerie moléculaire basée sur de nouveaux agents de contraste photonique.
En 2010, la PFIC va intégrer un nouvel espace de 300m² afin d'optimiser le développement des projets de R & D. Un nouveau trieur de cellules à haut débit sera installé et un nouveau projet en collaboration industrielle va débuter avec comme objectif l'imagerie non-invasive et automatisée de la cavité péritonéale à l’échelle cellulaire. (Projet PERSEE)
Collaborations
Projet de développement coordonné ou avec participation de la PFIC - collaboration
scientifique
- MEC-ORL : Evaluation du potentiel de l'endomicroscopie, en combinaison avec des
fluorophores approuvés cliniquement ou en essais clinique, pour la détection de lésions
cancéreuses ORL.
Collaboration avec le service de chirurgie tête et cou, le département de pathologie, le centre
de ressources biologiques et le service de biostatistique de l'IGR.
Ce travail bénéficie du soutien financier de l'Inca : n° O7/1D0604/END-119-5/LL-AC, 2007
- PERSEE : Développement d'un outil automatisé d'imagerie cellulaire in vivo pour
l'amélioration de la délimitation peropératoire des marges d'exérèses des tumeurs.
Collaboration avec les sociétés Mauna Kea Technologies et Endocontrol, l'Institut des
Systèmes Intelligents et Robotique et l'Institut Mutualiste Monsouris (financement OSEO)
- Partenariat avec la société Biocytex : développement de méthodes d'analyse des évènements
rares en cytométrie en flux : cellules et microparticules.
Activités d'enseignement
En 2009, plus de 50 programmes de recherche se sont appuyés sur la plate-forme. 130 scientifiques ont également été formés au cours d’ateliers pratiques de
microscopie et de cytométrie.
Ateliers de formations organisés par la PFICPour une utilisation optimale des instruments, la PFIC favorise la formation des chercheurs dont la fréquence d’utilisation du matériel est au moins bi-mensuelle.
Des stages de formation permettant une autonomie complète sur les microscopes confocaux, les cytomètres en flux et imageurs sont proposés par la PFIC selon le barème. La durée de formation est variable suivant le type d’instrument et est adaptée en fonction de l’utilisateur. Les dates de formation sont à définir avec les responsables techniques des instruments qui sont seuls habilités à réaliser les formations sur les instruments de la plate-forme.
Lorsque l’habilitation à utiliser l’instrument de façon autonome est délivrée à la suite de cette formation, l’utilisateur est admis, après réservation à utiliser de manière autonome l’instrument pour lequel il a été formé. Il est donc important de planifier cette formation avant le début de tout protocole.
Le coût d’utilisation de l’instrument s’effectue alors pour les chercheurs externes à l’IGR, selon le barème.
Responsabilité des utilisateurs autonomesTout utilisateur ayant reçu l’habilitation à utiliser un ou plusieurs instruments de la plate-forme est responsable du matériel utilisé. Il doit en conséquence laisser le matériel dans un parfait état de fonctionnement et de propreté après utilisation (objectifs de microscope nettoyés, liquide gaine réajusté et poubelles des cytomètres vidées, cage d’anesthésie nettoyée, etc…). Ces indications sont consignées dans les documents fournis lors de la formation.
Les utilisateurs doivent également indiquer immédiatement au personnel de la PFIC tout problème technique ou tout incident rencontré sur l’instrument.
Plus de cent soixante dix heures de formation ont été dispensées en interne cette année par la PFIC. 2/3 de ces formations ont concerné la cytométrie en flux et 1/3 l’imagerie.
Les personnels de tout statut ont participé à ces formations
| Formation | Responsable de la formation | Personnel concerné | Nb d’heures
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| Cytométrie en flux : Bases pratiques | Yann Lécluse et Philippe Rameau | Technicien, Thésard, Post doc, Chercheurs et médecins | 108 |
| Cytométrie en flux : Apoptose et cycle cellulaire | Philippe Rameau | Technicien, Thésard, Post doc, Chercheurs et médecins | 7 |
| Imagerie - Bioluminescence | Valérie Rouffiac | Thésard, Post doc, Chercheurs et médecins | 56h30 |
Activités d'enseignement extérieures
Corinne Laplace-Builhé : Cours imagerie Photonique dans le cadre des Masters II
- Master II Biotechnologie : Orléans
- Master II Physique Médicale : Paris XI
Appareils disponibles
Microscopie confocale
LSM510-META spectral (Zeiss)
Confocal SPE (Leica)
Microscopie confocale haut débit
Pathway 435 (Becton Dickinson)
Endomicroscopie confocale
Cellvizio 488 (Mauna Kea Technologies)
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Cytométrie en flux et tri cellulaire
Trieur MoFlo (Beckman Coulter)
Trieur de cellules Aria III BD
Trieur de cellules Influx BD
Analyseur FacsCalibur (Becton-Dickinson)
Analyseur LSR II (Becton-Dickinson) |
Imagerie photonique
IVIS 50 (Xenogen/ Caliper)
Macroscope AZ100 (Nikon)
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