Responsable

Véronique Chajès
Tél : 01 42 11 54 14
veronique.chajes@igr.fr
Pavillon de recherche 2

Le rôle déterminant des lipides d’origine alimentaire et issus du métabolisme endogène dans le développement de maladies chroniques (i.e. cancer, obésité, diabète) est suggéré par un nombre croissant d’études épidémiologiques et expérimentales. Le développement des outils analytiques pour l’analyse des lipides et de leurs partenaires associés (lipidomique) ouvre maintenant ce champ de recherche à de nombreuses applications dans le développement des biomarqueurs.

Approche
La plate-forme lipidomique propose l’utilisation des méthodologies basées sur la chromatographie gazeuse et la chromatographie liquide haute performance pour la détermination des profils en acides gras et vitamines antioxydantes, afin d’identifier des biomarqueurs des acides gras d’origine alimentaire et issus du métabolisme, utilisables dans le domaine de la cancérologie.
Ce profilage est applicable à différentes matrices :
- Extraits cellulaires
- Echantillons sanguins
- Biopsies de patients

Objectif
L’objectif de la plate-forme lipidomique est d’appliquer la technologie lipidomique pour la découverte de biomarqueurs des acides gras d’origine alimentaire et issus du métabolisme endogène dans les domaines suivants :

• Etudes épidémiologiques sur la relation entre biomarqueurs lipidiques et risque de cancer.
• Etudes épidémiologiques sur la relation entre biomarqueurs lipidiques et réponse aux traitements.
• Etudes expérimentales sur l’identification des altérations du métabolisme lipidique au cours des processus de carcinogenèse.

Services proposés

• Assistance pour le montage et la finalisation de projets de lipidomique
• Extraction des lipides, dérivation des acides gras et analyse des esters méthyliques d’acides gras (identification et la quantification de 60 acides gras) à partir de tissus, de cultures de cellules ou de liquides biologiques
• Extraction et analyse de vitamines liposolubles à partir de liquides biologiques (identification et la quantification de 12 vitamines liposolubles et caroténoïdes)

L’IGR a acquis et validé les technologies nécessaires pour la séparation et la quantification des acides gras et vitamines antioxydantes dans les échantillons biologiques. La plate-forme Lipidomique est pourvue des systèmes analytiques Agilent suivants :

• Systèmes d’extraction et de purification des lipides sur microcolonnes SPE.

• Système de chromatographie en phase gazeuse, injection on-column, détecteur FID, colonnes capillaires hautement polaires pour l’analyse des acides gras à haut débit. Une soixantaine d’acides gras (de 6 à 24 carbones, incluant 12 isomères trans d’origine industrielle et naturelle) sont identifiés et quantifiés.

• Système de chromatographie liquide haute performance couplée à un détecteur à barrette de diode pour l’analyse d’une douzaine de vitamines et caroténoïdes lipophiles.

Effectifs

Publications

Chajès V, Joulin V, Clavel-Chapelon F. The fatty acid desaturation index of blood lipids, as a biomarker of hepatic stearoyl-CoA desaturase expression, is a predictive factor of breast cancer risk. Curr Opin Lipidol. 2011 Feb; 22(1):6-10. Review.

Zischka H, Lichtmannegger J, Schulz S, Schmitt S, Jägemann N, Hamöller D, Jennen L, Rust C, Larochette N, Galluzzi L, Chajès V, Choi DW, DiSpirito AA, Esposito I, Goettlicher M, Summer KH, and Kroemer G. Mitochondrial membrane crosslinking and fragmentation in Wilson disease. J Clin Invest. 2011 Mar 1. pii: 45401. doi: 1172/JCI45401. 

Maillard V, Kuriki K, Lefebvre B, Boutron-Ruault MC, Lenoir GM, Joulin V, Clavel-Chapelon F, Chajès V. Serum carotenoids, tocopherol and retinol concentrations and breast cancer risk in the E3N-EPIC study. Int J Cancer. 2010 Sep 1; 127(5): 1188-96.

Thiébaut A, Rotival M, Gauthier E, Lenoir G, Boutron-Ruault MC, Joulin V, Clavel-Chapelon F, Chajès V. Correlation between serum phospholipid fatty acids and dietary intakes assessed a few years earlier. Nutr Cancer. 2009; 61(4): 500-9.

Chajès V, Thiébaut A, Rotival M, Gauthier E, Maillard V, Boutron-Ruault MC, Joulin V, Lenoir G, Clavel-Chapelon F. Serum phospholipid trans monounsaturated fatty acids are associated with increased risk of breast cancer in women. Am J Epidemiol. 2008 Jun 1; 167(11):1312-20. Epub 2008 Apr 4.

Chajès V, Cambot M, Moreau K, Lenoir GM, Joulin V. Acetyl-CoA carboxylase-alpha is essential to breast cancer cell survival, Cancer Res. 2006 May 15; 66(10): 5287-5294.

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Les prix sont basés sur la complexité de la demande analytique.
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