Directeur
Guido Kroemer
Tél. 01 42 11 60 46
Pavillon de recherche 1, porte 412
Contact
Nazanine Modjtahedi
nazanine.modjtahedi@igr.fr
Tél. : 01 42 11 54 91
Plate-forme Métabolomique
La métabolomique est la science qui permet l’étude systématique des métabolites cellulaires de moins de 1000 Daltons. La plate-forme propose l’application de cette technologie au profilage métabolomique des cellules cancéreuses afin d’identifier des biomarqueurs utilisables dans le domaine de la cancérologie. Ce profilage s’applique à différents types d‘échantillons biologiques :
- Extraits cellulaires
- Biopsie de patients
- Fluides biologiques
Services proposés
Découverte de métabolites et analyse métabolomique ciblée :
- Profilage : repérer les métabolites et leurs variations
- Identification : déterminer la structure chimique des métabolites
- Interprétation des résultats : établir les connections entre les métabolites découverts et les processus biologiques de la cellule cancéreuse grâce à des études biostatistiques
- Analyse quantitative des métabolites candidats.
Effectifs
Responsable scientifique : Guido Kroemer - Tél. 01 42 11 60 46
Coordinatrice scientifique : Nazanine Modjtahedi - Tél. 01 42 11 54 11
Responsable technique : Marie Scoazec - Tél. 01 42 11 45 93
Moyens techniques
La plate-forme est composée de trois systèmes analytiques Agilent :
- nanoLC/QTOF pour le profilage et l’identification de métabolites
- HPLC/QQQ pour l’analyse ciblée
- GC/QQQ pour l’identification et la quantification de métabolites
La sensibilité de cette technologie est liée au
couplage entre la chromatographie et la spectrométrie de masse. La nature des échantillons à analyser étant complexe et variée, des systèmes de séparation sont installés en amont des spectromètres pour permettre la détection d’un maximum de métabolites :
- la chromatographie gazeuse (GC)
- la chromatographie liquide haute performance (HPLC) et
- la nanochromatographie liquide haute performance (nanoLC)
Les études biostatistiques des résultats obtenus, après le profilage métabolomique, s’effectuent grâce à l’utilisation de logiciels puissants et spécifiquement développés à cet effet.
