Responsable
Murat Saparbaev
Réparation de l’ADN
Etude des protéines impliquées dans la réparation de l'ADN endommagé par les radicaux libres générés par le métabolisme cellulaire, les médicaments ou l'environnement.
Présentation de l'équipe
| Murat SAPARBAEV - DR2, CNRS |
Chercheurs
Jacques LAVAL (DR1 CNRS EMERITE) - Alexander ICHTCHENKO (CR1 CNRS)
Post-doctorants
Sophie COUVE-PRIVAT (Post-doc, FRM)
- Modesto REDREJO-RODRIGUEZ (Post-doc CNRS)
Stagiaires
Aksinya DEREVYANKO (Stagiaire Minist. Educ. Kazakhstan) -
Sabira TAIPAKOVA (Stagiaire Minist. Educ. Kazakhstan)
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Travaux et objectifs
L’activité scientifique du groupe a été consacrée à l’étude des processus destinés à maintenir l’intégrité du génome. Cette recherche vise à mettre en évidence, à l’échelle moléculaire, une relation entre un défaut de réparation de l’ADN et l’instabilité génétique que ce soit au niveau du nucléotide (substitution, insertion ou délétion) ou du chromosome. On peut penser, en effet, que l’origine des maladies dégénératives est liée à de tels défauts de la cellule.
Nous étudions les processus qui assurent l’intégrité du génome en particulier contre les espèces réactives de l'oxygène (EROs) qui sont à l'origine du stress oxydatif dans les cellules. Les EROs interagissent avec les protéines, les lipides et les acides nucléiques. Au niveau des acides nucléiques, les EROs interagissent avec les bases pour générer des résidus oxydés. D’autre part, les radicaux libres conduisent à la peroxydation des lipides. Les produits de cette peroxydation réagissent avec les bases en produisant des adduits exocycliques : les éthénobases. Lorsque ces diverses lésions persistent dans l’ADN, leurs propriétés miscodantes font qu’elles sont impliquées dans la mutagenèse, la cancérogenèse, le vieillissement et l’arrêt de la réplication dans la létalité cellulaire.
Collaborations
nationales et internationales
Dr. Betsy SUTHERLAND, Brookhaven National Laboratory, Etats Unis. Etude de la réparation des lésions groupées générées dans l’ADN par les radiations ionisantes (Sutherland et al., 2001 ; 2002 ; 2003 ; 2004).
Dr. Rhoderick ELDER, CRC Carcinogenesis Group, Manchester, UK. Génération de souris génétiquement modifiées (Saparbaev et al., 2002; Gros et al., 2004).
Prof. Daniel GARIN (MC), Centre de Recherches du Service de Santé des Armés (CRSSA), Laboratoire de Virologie, La Tronche. Mise au point d’un inhibiteur des enzymes viraux (Scaramozzino et al., 2003 ; Duraffour et al., 2007).
Dr. Dindial RAMOTAR, Faculté de Médicine, Université de Montréal, Centre du Recherche Guy Bernier, Québec, Canada. Génération de souche de levure génétiquement modifiées (Shatila et al., 2005 ; Ishchenko et al., 2005).
Dr. Solange Morera, Dr Solange Moréra, LEBS Bât. 34 - CNRS FRE2930 1 Av de la terrasse, 91198 Gif sur Yvette Cedex. Etudes structurales des AP endonucléases impliquées dans la voie RIN.
Dr. Hiroshi IDE, Department of Mathematical and Life Sciences, Graduate School of Science, Hiroshima University, Hiroshima, JAPON. Synthèse d'oligonucléotides contenant des résidus alpha-2’-deoxyadenosine et alpha-thymidine (Gros et al., 2004 ; Ishchenko et al., 2004).
Dr Filippo ROSSELLI, Institut Gustave Roussy, FRE2939 C.N.R.S. 39, rue Camille Desmoulins, 94805 Villejuif Cedex, France (Couvé-Privat et al., 2007).
Protocoles
utilisés
Protocoles de biologie moléculaire conventionnelle : Southern et Western blot, clonage, mutagènese dirigée, siARN, transformation et transfections, chromatographie.
Construction de l’ADN modifiée et Dosage des enzymes de réparation de l’ADN en utilisant : oilgonucléotides marqués à 32P, l’ADN chromosomique marqués à 3H, oligonucléotides fluorescentes, l’ADN plasmidique supertorsadées.
Purification des enzymes de réparation de l’ADN. Génétique de colibacille (Escherichia coli)
et levure (Saccharomyces cerevisiae et pombe) : construction de souches, transformation, expression de protéines recombinantes.
Technique de séparation : FPLC, HPLC, gel electrophorese, French presse.
